MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 18503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016146	ATAG	2	8	55	62	50 %	25 %	25 %	0 %	357420709
2	NC_016146	AGA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
3	NC_016146	A	7	7	111	117	100 %	0 %	0 %	0 %	357420709
4	NC_016146	CAT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420709
5	NC_016146	TAG	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
6	NC_016146	ATAA	2	8	220	227	75 %	25 %	0 %	0 %	357420709
7	NC_016146	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
8	NC_016146	GAA	2	6	317	322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
9	NC_016146	ATA	2	6	374	379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420709
10	NC_016146	A	7	7	391	397	100 %	0 %	0 %	0 %	357420709
11	NC_016146	AAAAT	2	10	401	410	80 %	20 %	0 %	0 %	357420709
12	NC_016146	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420709
13	NC_016146	AT	3	6	440	445	50 %	50 %	0 %	0 %	357420709
14	NC_016146	GA	3	6	465	470	50 %	0 %	50 %	0 %	357420709
15	NC_016146	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
16	NC_016146	TCC	2	6	491	496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420709
17	NC_016146	A	6	6	499	504	100 %	0 %	0 %	0 %	357420709
18	NC_016146	T	7	7	522	528	0 %	100 %	0 %	0 %	357420709
19	NC_016146	AGA	2	6	604	609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
20	NC_016146	AGA	2	6	624	629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
21	NC_016146	A	7	7	678	684	100 %	0 %	0 %	0 %	357420709
22	NC_016146	ATG	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
23	NC_016146	ATTA	2	8	829	836	50 %	50 %	0 %	0 %	357420709
24	NC_016146	ATG	2	6	892	897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
25	NC_016146	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
26	NC_016146	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	357420709
27	NC_016146	AGA	2	6	942	947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
28	NC_016146	AGG	2	6	969	974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420709
29	NC_016146	AT	3	6	1019	1024	50 %	50 %	0 %	0 %	357420709
30	NC_016146	TGA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
31	NC_016146	A	6	6	1096	1101	100 %	0 %	0 %	0 %	357420709
32	NC_016146	TCA	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420709
33	NC_016146	A	8	8	1164	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	357420709
34	NC_016146	TAAA	2	8	1193	1200	75 %	25 %	0 %	0 %	357420709
35	NC_016146	A	7	7	1215	1221	100 %	0 %	0 %	0 %	357420709
36	NC_016146	TTAA	2	8	1238	1245	50 %	50 %	0 %	0 %	357420709
37	NC_016146	T	6	6	1252	1257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016146	GAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016146	TAT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
40	NC_016146	A	6	6	1312	1317	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
41	NC_016146	T	6	6	1360	1365	0 %	100 %	0 %	0 %	357420710
42	NC_016146	A	8	8	1368	1375	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
43	NC_016146	A	7	7	1389	1395	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
44	NC_016146	TA	3	6	1422	1427	50 %	50 %	0 %	0 %	357420710
45	NC_016146	T	7	7	1485	1491	0 %	100 %	0 %	0 %	357420710
46	NC_016146	A	7	7	1493	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
47	NC_016146	AGA	2	6	1522	1527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
48	NC_016146	A	6	6	1540	1545	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
49	NC_016146	TAC	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
50	NC_016146	AGA	2	6	1570	1575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
51	NC_016146	T	7	7	1594	1600	0 %	100 %	0 %	0 %	357420710
52	NC_016146	A	8	8	1602	1609	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
53	NC_016146	A	14	14	1622	1635	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
54	NC_016146	A	6	6	1669	1674	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
55	NC_016146	A	8	8	1687	1694	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
56	NC_016146	TTC	2	6	1705	1710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
57	NC_016146	ATC	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
58	NC_016146	AT	3	6	1754	1759	50 %	50 %	0 %	0 %	357420710
59	NC_016146	GAAA	2	8	1814	1821	75 %	0 %	25 %	0 %	357420710
60	NC_016146	A	9	9	1832	1840	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
61	NC_016146	GAA	2	6	1871	1876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
62	NC_016146	A	7	7	1894	1900	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
63	NC_016146	AGA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
64	NC_016146	ATT	2	6	1911	1916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
65	NC_016146	A	7	7	1949	1955	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
66	NC_016146	A	6	6	1977	1982	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
67	NC_016146	A	6	6	2010	2015	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
68	NC_016146	A	8	8	2023	2030	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
69	NC_016146	A	7	7	2039	2045	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
70	NC_016146	AGAAA	2	10	2048	2057	80 %	0 %	20 %	0 %	357420710
71	NC_016146	A	6	6	2069	2074	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
72	NC_016146	A	8	8	2076	2083	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
73	NC_016146	A	8	8	2103	2110	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
74	NC_016146	A	6	6	2112	2117	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
75	NC_016146	ATG	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
76	NC_016146	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
77	NC_016146	GAT	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
78	NC_016146	AGA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
79	NC_016146	TAT	2	6	2365	2370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
80	NC_016146	GGA	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420710
81	NC_016146	AGC	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420710
82	NC_016146	AAT	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420710
83	NC_016146	T	6	6	2515	2520	0 %	100 %	0 %	0 %	357420710
84	NC_016146	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
85	NC_016146	AAG	2	6	2631	2636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
86	NC_016146	TAT	2	6	2668	2673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
87	NC_016146	GAA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
88	NC_016146	ATCC	2	8	2775	2782	25 %	25 %	0 %	50 %	357420710
89	NC_016146	TAG	2	6	2841	2846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
90	NC_016146	TTA	2	6	2852	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
91	NC_016146	CTT	2	6	2907	2912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
92	NC_016146	AAAGGA	2	12	2918	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
93	NC_016146	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
94	NC_016146	AGG	2	6	2953	2958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420710
95	NC_016146	ATC	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
96	NC_016146	A	6	6	3010	3015	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
97	NC_016146	CAG	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420710
98	NC_016146	AAC	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420710
99	NC_016146	AGA	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
100	NC_016146	AAATAA	2	12	3255	3266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	357420710
101	NC_016146	ATT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
102	NC_016146	AAT	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420710
103	NC_016146	A	7	7	3466	3472	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
104	NC_016146	TA	3	6	3502	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	357420710
105	NC_016146	ATGG	2	8	3536	3543	25 %	25 %	50 %	0 %	357420710
106	NC_016146	TC	3	6	3547	3552	0 %	50 %	0 %	50 %	357420710
107	NC_016146	A	8	8	3558	3565	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
108	NC_016146	A	6	6	3567	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
109	NC_016146	TAC	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
110	NC_016146	GATT	2	8	3678	3685	25 %	50 %	25 %	0 %	357420710
111	NC_016146	AAT	2	6	3707	3712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420710
112	NC_016146	CTT	2	6	3723	3728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
113	NC_016146	AGA	2	6	3742	3747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
114	NC_016146	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
115	NC_016146	TTG	2	6	3822	3827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420710
116	NC_016146	GAA	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
117	NC_016146	A	7	7	3857	3863	100 %	0 %	0 %	0 %	357420710
118	NC_016146	A	6	6	3906	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	357420711
119	NC_016146	AAG	2	6	3922	3927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420711
120	NC_016146	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
121	NC_016146	T	6	6	4018	4023	0 %	100 %	0 %	0 %	357420711
122	NC_016146	A	7	7	4025	4031	100 %	0 %	0 %	0 %	357420711
123	NC_016146	A	7	7	4034	4040	100 %	0 %	0 %	0 %	357420711
124	NC_016146	AGT	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420711
125	NC_016146	CTAC	2	8	4119	4126	25 %	25 %	0 %	50 %	357420711
126	NC_016146	AGA	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420711
127	NC_016146	AGGA	2	8	4216	4223	50 %	0 %	50 %	0 %	357420711
128	NC_016146	GAA	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420711
129	NC_016146	A	6	6	4268	4273	100 %	0 %	0 %	0 %	357420711
130	NC_016146	TTTC	2	8	4317	4324	0 %	75 %	0 %	25 %	357420711
131	NC_016146	TAGAAA	2	12	4339	4350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	357420711
132	NC_016146	ATT	2	6	4451	4456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
133	NC_016146	ATT	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
134	NC_016146	GAT	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420711
135	NC_016146	AGG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420711
136	NC_016146	T	9	9	4602	4610	0 %	100 %	0 %	0 %	357420711
137	NC_016146	TTA	2	6	4618	4623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
138	NC_016146	ATTT	2	8	4627	4634	25 %	75 %	0 %	0 %	357420711
139	NC_016146	A	7	7	4635	4641	100 %	0 %	0 %	0 %	357420711
140	NC_016146	A	6	6	4643	4648	100 %	0 %	0 %	0 %	357420711
141	NC_016146	A	6	6	4764	4769	100 %	0 %	0 %	0 %	357420711
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272	NC_016146	TAT	2	6	8670	8675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420714
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